～摘錄自環保署

水污染防治基金收支保管及運用辦法

第一條　為防治水污染，確保水資源之清潔，維護生態體系，改善生活環境，增進國民健康，特依水污染防治法（以下簡稱本法）第十一條第六項規定，設置水污染防治基金（以下簡稱本基金），並依同條項及預算法第二十一條規定，訂定本辦法。

第二條　本基金為預算法第四條第一項第二款所定之特種基金，隸屬於環境保護基金項下，編製附屬單位預算之分預算，以行政院環境保護署（以下簡稱本署）為主管機關。

第三條　本基金之來源如下：

第四條　本基金之用途如下：

本基金來源屬前條第三款者，應優先支用於該違反本法義務者所污染水體之整治。

第五條　本基金之保管及運用應注重收益性及安全性，其存儲並應依公庫法及其相關法令規定辦理。

第六條　本基金為應業務需要，得購買政府公債、國庫券或其他短期票券。

第七條　本基金之收支、保管及運用，應設水污染防治基金管理會（以下簡稱本會），置委員十七人至二十三人，其中一人為召集人，由本署署長指定副署長一人兼任；其餘委員由本署署長遴聘有關機關（構）代表、學者、專家及民間團體代表擔任，並指定一人兼任副召集人。
前項學者、專家及民間團體代表，不得少於委員總人數三分之二。
本會委員任期二年，期滿得續聘之；均為無給職。

第八條    本會之任務如下：

第九條    本會委員由機關（構）或民間團體代表出任者，其職務異動時，應改派代表補足原任期；專家或學者出缺時，應予補聘，其任期至原聘任委員任期屆滿之日止。

第十條    本會置執行秘書一人，承召集人之命，綜理會務；副執行秘書一人及工作人員若干人，辦理所任事務；均由召集人就本署現職人員派兼之。

第十一條  本會每半年開會一次，必要時得召開臨時會議，均由召集人召集之；召集人因故不能出席時，由副召集人代理之。
本會之會議應有全體委員過半數之出席始得開會；應有出席委員過半數之同意始得決議；正反意見同數時，取決於主席。
前項會議，委員應親自出席，不得代理。但由機關（構）代表及民間團體代表兼任之委員，因故不能出席時，得指派代表出席，並參與會議發言及表決。

第十二條  本基金有關預算編製與執行及決算編造，應依預算法、會計法、決算法、審計法及相關法令規定辦理。

第十三條  本基金會計事務之處理，應依規定訂定會計制度。

第十四條  本基金年度決算如有賸餘，應依規定辦理分配。

第十五條  本基金結束時，應予結算，其餘存權益應解繳國庫。

第十六條  本辦法施行日期，由主管機關定之。
本辦法修正條文自發布日施行。
水污染防治基金收支保管及運用辦法第三條、第四條修正總說明
水污染防治基金收支保管及運用辦法（以下簡稱本辦法）係於一百零三年八月十二日訂定發布、一百零四年五月一日施行，並於一百零四年九月七日修正施行。茲配合水污染防治法（以下簡稱本法）於一百零七年六月十三日修正施行，將中央主管機關對於排放廢（污）水於地面水體之事業及污水下水道系統（不含公共污水下水道系統及社區專用污水下水道系統），以及地方政府應對依下水道法公告之下水道使用區域內，未將污水排洩於下水道之家戶，分別徵收水污染防治費，並規定不同類別之水污染防治費支用項目，爰修正本辦法第三條、第四條，配合本法第十一條第一項及第三項第一款規定，修正本基金之來源及用途。